Organizace vznikla 20. listopadu 1998. První foosballové mistrovství na území České republiky se konalo 24. dubna 1999 v Praze. ČFO je od roku 2003 členem mezinárodní foosballové federace ITSF. V roce 2006 se ČFO jako první z foosballových federací připojila k antidopingové chartě (ADV).
První ligová soutěž v tomto sportu byla zahájena v Praze 1. května 1999 nultým ročníkem.
V rámci začátku foosballové sezóny, která je od září do června, se každoročně rozjíždí seriál turnajů pořádaných ČFO.
V roce 2009 a 2010 ČFO premiérově uspořádala ve spolupráci s Robertosport a CBFA seriál Mistrovství světa, jehož se zúčastnila kompletní světová špička z dvaceti zemí.